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Megan Lee nasceu e cresceu na área de Washington DC. Um dos três irmãos, ela é o bebê da família. Ela se formou na escola de ciência e tecnologia Eleanor Roosevelt High School. Ela obteve um bacharelado em biologia pela George Mason University, onde seu foco era em genética, imunologia e microbiologia. Atualmente, ela possui uma carreira em pesquisa biomédica de doenças transmissíveis.